平地升起一大团烟雾，机械哥斯拉阻挡失败，人们还是只好派出飞机，坦克，镭射炮这个抗怪三宝来对付两只哥斯拉，不过嘛，还是一丁点儿用都没有，轻轻松松突破了防线，来到了研究所所在的京都。
终焉哥斯拉来破坏周围的楼房，破坏周围的地标性建筑，平成哥斯拉则是俯下身体，开始仔细的感应自已那个同族所散发出来的气息，不过在这之前，博士已经提议把利多尔和五条转移到了一个地下室里面，切断了利多尔和平成哥斯拉之间的联系。
大门一关，平成在外面已经很有耐心的找了一阵子，明明已经感应的清清楚楚了，但是一旦走进那个地方就突然消失不见，越想越气，背鳍闪烁蓝色的光芒，把那个研究所连带着研究所身后的街道用放射热线给摧毁的一干二净，造成的损失还更大了。
“找到没有？”
周围的楼房已经被终焉哥斯拉用拳头以及牙齿给夷为平地，然后看到平成哥斯拉向着自已走过来，开口询问情况，平成哥斯拉有些失魂落魄的摇了摇头，终焉哥斯拉看到他这个情况也不好再多说什么，拍了拍后背，叫他和自已一起去海边散散心，其实刚才自已好像也感应到了，有一股特殊的脑电波正在向着自已传递，不过实在是太微弱了，还需要交给自已那个好像网络不好的系统来翻译翻译。
这个事情之后，青木回到了G-FORCE，却意外的从上级那边得知，因为上一次哥斯拉入侵，自已没有驾驶机械哥斯拉出战，而是跑去看小恐龙了。
上级把折成纸飞机的文件交给他，青木打开一看，自已被降职了，看到这个消息的青木两眼一黑，但也只能做罢，并且还得知自已的翔鹰号也被那个红色皮肤的怪人给看上了，要将其进行一番大改特改。
抱着试一试的心态，他找到那个红色怪人，然后将其说明了一下自已原先的构想，简而言之就是之前未能够实现的合体计划，红色怪人听到他的话，意外的发现他说的和这个设计图纸上面的一点很像，那也是合体计划，1号机械哥斯拉的备案计划刚好可以采用在这个2号机械哥斯拉的身上了。
另外一边，得知了小恐龙利多尔出生的上级来到了这个地下动物园查看情况，然后叫五条全权负责小恐龙的日常生活，并且还通过了X光的扫描，意外的发现小恐龙的身上还有着用于控制下半身活动的第二大脑。
想到小恐龙和外面那两只哥斯拉隶属于同族，也就确认那两只也拥有同样的第二大脑，这样一看，到时候可以叫那个红色怪人给机械哥斯拉身上安装原先机械哥斯拉爪子上的G粉碎机，然后刺入第二大脑，使用电流让哥斯拉的第二大脑完全瘫痪，然后就能够任人宰割了。
红色怪人点了点头，表示这个方案没有一点毛病，说句实在话，为了躲开那个红尘当中的那只野猪头，自已都更愿意亲自下场来干的，无奈那个玩意儿看这里看的特别紧啊，只能把大多数活交给人类来完成。
“等着吧，等我成长为了最完美的究极生命体，我一定要亲自见一见你！”红色怪人咬牙切齿的说道，这个时候首相也靠近了，正打算和红色怪人交谈一点事情，见此情况，红色怪人收起了满脸愤怒的神情，转换而成的原先那个文质彬彬的模样开始进行讨论。
另一边，原先是无法接受这个计划的五条在经过长官一阵苦口婆心的劝说，为了全人类着想，五条最终还是答应了利用小恐龙把两只哥斯拉引诱到一个小岛上面，然后用三枝的感应能力感应到第二大脑然后使用粉碎机刺入皮肤电流瘫痪大脑的方法，但是五条表示自已想和小恐龙一同前往，没办法，长官最终还是答应并且叫几个士兵保护好五条。
情况不容有变，任务马上就要开始，在运输箱里面，利多尔很紧张，眼睛不断的散发着红色光芒，背后小小的圆钝背鳍也在闪烁悠悠蓝光，五条也只能尽力不断的轻轻抚摸利力多安抚情绪，尽管她自已也很紧张，稍不注意就会直接丢失性命。
运输机搭载着运输箱起飞，原本计划还好好的，但是没有意外，老天总是要造成一点意外，一座规模较小的火山突然发生爆炸，在其中吸收岩浆能量以及核辐射能量让身体变红的翼龙拉顿从火山当中飞了出来，追寻着利多尔所发出来的声波，向着樱花国快速飞来，带起来的冲击波摧毁着周边路上的建筑，仅仅只是几个眨眼的时间段，拉顿便顷刻间摧毁了运输机，爪子轻盈的一抓，抓住了运输箱，营救自已异父异母的亲兄弟，然后抓着运输箱，拍打翅膀前往幕张。
计划被破坏，卫星检测到两只哥斯拉感应到了利多尔所散发出来的电波，已经离开海边，同时向着幕张地区所赶过去，为了减少损失，G-FORCE即刻启动了新研究出来的机械哥斯拉，被清空的街道上面，两架战车从基地里面伸出来，快速向着地区开过去，在基地上方打开的门中，一架巨大并且极具线条的飞机先飞出来，先行向着幕张地区飞过去，打算先消灭拉顿让计划重新施展。
赶到地方的时候，天色已经变暗，拉顿盘旋在天上看到了空中的飞机，找了一片公园，把运输箱轻轻的放下来，张开嘴巴发出了一阵安慰的叫声，然后拍打翅膀先让自已身体漂浮。
过后眼神坚定，义无反顾的对着天上的飞机冲了上去，然后张开嘴巴喷射出紫色的闪电状射线对着飞机打了上去，飞机在空中闪躲，但是被拉顿抓住机会飞到飞机的上面伸出爪子对着机翼抓上去，受到干扰，还没有经受过一次测试的飞机被拉顿直接拍落到了地面上。
回过头来，看到了两架巨大的战车向着战场开来，张开嘴巴，持续的喷射出射线来进行攻击，然而，用外星的钢铁造成的身躯完完全全的无视拉菲的射线。
驾驶员轻描淡写按下一个按钮，反手就是一发强化的等离子榴弹炮贴脸击中拉顿，胸部受到大面积损伤，并且喷射绿色鲜血的拉顿垂直向着身后的大楼撞去，撞塌大楼掉到地上奄奄一息，两架战车身上的各种导弹开始对着拉顿身上狂轰滥炸，直到把鲜红的翅膀给重新打成了灰色，身上绿色的鲜血淋漓，翅膀翼模大面积破损。
就算是遭遇了如此大的攻击，拉顿依然没有倒下，翅膀强撑着身体，抬头看向远方的集装箱，耳边很快传来了一阵熟悉的吼叫，听到声音，拉顿并没有转头，身体轻轻的瘫倒在地，闭上眼睛，陷入昏迷状态。
“吼——！”
众人抬头看去，终焉哥斯拉大跨步向着这边走来，一旁的平成哥斯拉眼中清晰可见的愤怒根本抵挡不住，走着走着，平成哥斯拉甚至于还少见的直接跑了起来，举起拳头就对着旁边的那个较大体型的战车打了上去，终焉哥斯拉抬头，目光盯向了天上的飞机。
