米花町的中心矗立着一座古老而宏伟的钟楼，它是这座城市的标志性建筑之一，见证了米花町的历史变迁。传说，每到月圆之夜，钟楼里会出现一个“钟楼怪人”，他会发出诡异的声响，给接近钟楼的人带来厄运。这个传说在米花町流传己久，虽然大多数人都将其当作无稽之谈，但每当月圆之夜，钟楼附近还是会变得格外冷清。
最近，关于“钟楼怪人”的传说又开始甚嚣尘上。一些在附近居住或工作的人声称，在月圆之夜听到了钟楼里传来奇怪的声音，像是沉重的叹息，又像是痛苦的低吟。还有人说看到一个黑影在钟楼的窗口一闪而过。这些传闻引起了米花町居民的恐慌，尤其是孩子们，晚上都不敢独自出门。
少年侦探团听闻此事后，决定在月圆之夜前往钟楼一探究竟，揭开“钟楼怪人”的神秘面纱。柯南认为，世上不可能有真正的怪人，一定是有人在背后搞鬼。
月圆之夜终于来临，柯南、元太、步美、光彦和灰原哀带着手电筒和一些简单的工具，悄悄来到了钟楼。月光洒在钟楼上，投下斑驳的阴影，让原本庄严的钟楼此刻显得有些阴森。
他们小心翼翼地走进钟楼的大门，里面弥漫着一股陈旧的气息。借着微弱的手电筒光，他们看到墙壁上布满了岁月的痕迹。突然，一阵低沉的声音传来，步美吓得紧紧抓住了灰原哀的手臂。
“别害怕，步美，我们一起去看看。”柯南安慰道。
众人顺着声音的方向，来到了钟楼的顶层。在那里，他们发现声音似乎是从一个巨大的钟后面传来的。柯南示意大家安静，然后慢慢绕到钟的另一侧。
眼前的景象让他们大吃一惊，一个衣衫褴褛的老人蜷缩在角落里，身体不停地颤抖着。看到少年侦探团，老人惊恐地瞪大了眼睛。
“老爷爷，你是谁？为什么会在这里发出奇怪的声音？”柯南轻声问道。
老人犹豫了一下，缓缓道出了缘由。原来，他是钟楼的前管理员，年轻时一首负责钟楼的维护工作。后来钟楼现代化改造，他被辞退了，但他对钟楼有着深厚的感情，一首舍不得离开。每到月圆之夜，他就会偷偷回到钟楼，回忆过去的时光。他发出的声音，只是因为触景生情，忍不住叹息和低吟。而那个被人看到的黑影，就是他在钟楼里走动的身影。
少年侦探团听了老人的讲述，心中充满了同情。他们决定帮助老人，让他能够合法地继续留在钟楼。第二天，少年侦探团找到了钟楼的管理部门，向他们说明了老人的情况。管理部门的工作人员被老人对钟楼的深情所打动，决定重新聘请老人担任钟楼的顾问，负责给游客讲述钟楼的历史。
随着“钟楼怪人”真相的大白，米花町的居民们不再恐慌，而钟楼也恢复了往日的宁静与庄严。少年侦探团又一次用他们的勇气和智慧，解开了一个看似神秘的谜团，为米花町带来了安宁。
老人成为钟楼顾问后，整个人都焕发出新的活力。他精心准备了许多关于钟楼的历史故事和奇闻轶事，每当有游客前来，他都会热情地讲述，让大家对这座古老的建筑有了更深的了解。钟楼也因为老人生动的讲解，吸引了更多游客，成为米花町更具魅力的旅游景点。
少年侦探团因为揭开“钟楼怪人”的真相，受到了米花町居民的一致称赞。报纸和电视台都报道了他们的事迹，这让他们在整个城市都小有名气。许多家长教育自己的孩子要像少年侦探团一样，勇敢探索，用科学的思维去解开生活中的谜团。
面对赞誉，少年侦探团并没有骄傲自满。他们深知，还有许多未知的挑战等待着他们。一天，元太拿着一份报纸，兴奋地对大家说：“你们看，最近米花町的公园老是丢东西，好多人放在长椅上的包、外套，一转眼就没了。”
柯南皱了皱眉头，说：“看来我们又有新任务了。”于是，少年侦探团决定将目标锁定在公园盗窃案上。他们先来到公园，仔细勘查现场。柯南在几个经常发生盗窃的长椅附近发现了一些奇怪的脚印，这些脚印很小，而且步伐间隔不规则，不像是成年人留下的。
光彦则去询问公园的管理员和一些常客。管理员说，最近公园里出现了几个形迹可疑的小孩，总是在人多的地方晃悠，但每次询问他们，这些小孩就跑开了。
步美发挥她的细心，在公园的草丛里找到了一个小布片，上面绣着一个小小的“X”字样。灰原哀推测：“这个‘X’可能是某个团伙或者个人的标记，也许和盗窃案有关。”
根据这些线索，少年侦探团制定了计划。他们分成几组，在公园各个角落暗中观察。果然，没过多久，他们就发现了几个鬼鬼祟祟的小孩。这几个小孩互相配合，一个在前面吸引游客的注意力，另外几个就趁机偷走游客放在长椅上的东西。
少年侦探团迅速行动，将这几个小孩团团围住。其中一个看起来像是头目的小孩不服气地说：“你们凭什么抓我们，我们只是闹着玩的。”
柯南严肃地说：“偷东西可不是闹着玩的，这是不对的行为。你们为什么要这么做？”
经过询问，原来这几个小孩家庭条件都不太好，他们看到公园里游客们的东西很羡慕，一时起了贪念，就想出了这个办法。少年侦探团听了，心中既生气又同情。
他们决定帮助这几个小孩，先让他们把偷来的东西还给失主，然后带着他们找到了社区工作人员，向工作人员说明了情况。社区决定为这几个小孩的家庭提供一些帮助，同时也安排了志愿者对他们进行教育和引导。
在少年侦探团的努力下，公园盗窃案得到了解决。而他们也明白，维护米花町的和谐与安宁，是他们永远的使命，未来还会有更多的挑战等着他们去面对。
